Parameterdetails

Parametername: Isolierung von cfDNA aus Plasma

Version: 1 Gültig ab 17.03.2026

Beschreibung* Isolierung von cfDNA aus Plasma, Liquor und Glaskörper-Punktat mittels Magnetic Bead Extraktion

Ziel und Zweck der Untersuchung Die cfDNA-Extraktion umfasst biochemische Methoden zur Extraktion von zellfreier DNA aus Plasma, Liquor und Glaskörper-Punktat. Die isolierte cfDNA kann in weiterer Folge in zahlreichen Methoden zur Analyse von DNA-Veränderungen der zirkulierenden Tumor-DNA auf somatischer Ebene im Rahmen des molekularen Tumor-Profiling (sog. Liquid Biopsy) genutzt werden.

Prinzip des Verfahrens Das automatisierte Verfahren umfasst 4 Schritte: Lyse, Bindung, Waschen und Elution.
Die cfDNA wird zunächst aus mit Stabilisator versetztem Plasma durch Bindung an eine Silica-Oberfläche von Partikeln in der Gegenwart eines chaotropen Salzes extrahiert. Die Partikel werden anschließend vom Lysat durch einen Magneten getrennt, während die Protein-Verunreinigungen durch Behandlung mit ProteinaseK entfernt wird. Die magnetischen Partikel werden anschließend gewaschen und die cfDNA in Elutionspuffer eluiert.

Literatur S. Gravina, J. M. Sedivy, J. Vijg: The dark side of circulating nucleic acids. In: Aging cell. Band 15, Nummer 3, Juni 2016, S. 398–399
G. Francis, S. Stein: Circulating Cell-Free Tumour DNA in the Management of Cancer. In: International journal of molecular sciences. Band 16, Nummer 6, 2015, S. 14122–14142
L. L. Chan, P. Jiang: Bioinformatics analysis of circulating cell-free DNA sequencing data. In: Clinical biochemistry. Band 48, Nummer 15, Oktober 2015, S. 962–975
C. Alix-Panabières, K. Pantel: Clinical Applications of Circulating Tumor Cells and Circulating Tumor DNA as Liquid Biopsy. In: Cancer discovery. Band 6, Nummer 5, Mai 2016, S. 479–491

Ergebniseinheit

Einheiten(sonstige) ng/µl

Synonyme cfDNA-Extraktion, cfDNA-Isolation, zirkulierende Tumor-DNA, Liquid Biopsy, Molekulares Tumor-Profiling, zellfreie DNA

Analysenfrequenz bei Bedarf

Nachforderungsmöglichkeit der Analyse
(Stunden, Tage) nicht zutreffend (Spezialabnahme-Röhrchen erforderlich)

Spezimen
(Plasma, Serum, Harn) Plasma, Liquor, Glaskörper-Punktat

Sammelperiode nicht zutreffend

Mindestvolumen pro Anforderung vor Zentrifugation
(vor Zentrifugation) 8ml Blut, 3ml Liquor / Glaskörper-Punktat

Abnahmegefäß inkl. Zusatzstoffe

Abnahmegefäß inkl. Zusatzstoffe(sonstige) Paxgene/Streck/Sarsted cfDNA Spezial-Röhrchen

Spezielle Präanalytik - Probentransport INTERN:
Streck, PAXgene oder Sarstedt ccfDNA-Spezialmonovetten erforderlich (bestellbar über Anstaltsapotheke).
Blut unmittelbar nach Gewinnung mittels ROHRPOST INS ZIMCL einsenden

EXTERN:
Streck, PAXgene oder Sarstedt ccfDNA-Spezialmonovetten erforderlich. Blut unmittelbar nach Gewinnung bei Raumtemperatur ins ZIMCL versenden.

Messbereich 0,01-10ng/µl

Allgemeine Störungen
(z.B. Lipämie, Hämolyse, Bilirubinämie) Verwendung eines inadäquaten Spezimens, Nukleinsäure-Degradation durch zu alte Probe, zu wenig Probevolumen (s.o.),
Hämolyse, Gerinnsel-Bildung, Phenole, Polysaccharide, Inhibition

Kreuzreaktionen
(z.B. immunologisch) nicht zutreffend

Kennzeichnung des Analyse-Verfahrens nach MPG / IVDR in-house Validierung

Erklärung nach IVDR 2017/746
(für in-house Methoden) ERKLÄRUNG nach Art. 5 (5) der EU-Verordnung über In-vitro-Diagnostika (EU) 2017/746 (IVDR) zur Eigenherstellung eines IVD in Gesundheitseinrichtungen:

Wir erklären in alleiniger Verantwortung, dass das unten angeführte Produkt, welches im Wege der Eigenherstellung von uns hergestellt wird, allen Anforderungen der IVD-Verordnung (EU) 2017/746, Anhang I Grundlegende Sicherheits- und Leistungsanforderungen, entspricht, die anwendbar sind:

Das Produkt wurde in unseren eigenen Räumlichkeiten von uns in nicht industriellem Maßstab gefertigt und wird ausschließlich in unserer Gesundheitseinrichtung betrieben.

Gesundheitseinrichtung: Tirol Kliniken, Anichstr. 35, 6020 Innsbruck
Geschäftsführer: Mag. Stefan Deflorian
Leiter Qualitätsmanagement: Martin Weichselbraun, MSc.

Produktname: Isolierung von cfDNA aus Plasma

Ort und Datum der Erstellung: Innsbruck, am: 10.04.2022

Produktklassifizierung nach Anhang VIII: Klasse: C

Ausdruck gültig am 06.04.2026

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